Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pate1E9Q658 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate1E9Q658 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Pate1E9Q658 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Pate1E9Q658 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pate1E9Q658 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pate1E9Q658 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pate1E9Q658 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms