Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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