Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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