Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo5cE9Q1F5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo5cE9Q1F5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms