Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ryr1E9PZQ0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms