Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbf2E9PXF8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms