Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc8E9PWG2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc8E9PWG2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms