Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms