Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms