Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde2E9PUP1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms