Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrt2E9PUL5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt2E9PUL5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms