Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms