Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9630041A04RikD3Z3U4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms