Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms