Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms