Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nlrc5C3VPR6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc5C3VPR6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms