Protein–RNA interactions for Protein: C0HKG6

Rnaset2b, Ribonuclease T2-B, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaset2bC0HKG6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnaset2bC0HKG6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaset2bC0HKG6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaset2bC0HKG6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaset2bC0HKG6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaset2bC0HKG6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaset2bC0HKG6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaset2bC0HKG6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaset2bC0HKG6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaset2bC0HKG6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaset2bC0HKG6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaset2bC0HKG6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaset2bC0HKG6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaset2bC0HKG6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaset2bC0HKG6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaset2bC0HKG6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaset2bC0HKG6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaset2bC0HKG6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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