Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxpe3B9EKK6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms