Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms