Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms