Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms