Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clrn2B2RVW2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms