Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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