Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apol7aB2RT54 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms