Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms