Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H60cB1B213 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H60cB1B213 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms