Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU022751B1B0V2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms