Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Otud3B1AZ99 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otud3B1AZ99 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms