Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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