Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms