Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl41A2AUC9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl41A2AUC9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl41A2AUC9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl41A2AUC9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl41A2AUC9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl41A2AUC9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl41A2AUC9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl41A2AUC9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl41A2AUC9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl41A2AUC9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl41A2AUC9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl41A2AUC9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl41A2AUC9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms