Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ism1A2ATD1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms