Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms