Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SktA2AQ25 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms