Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms