Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
AI481877A2ALV5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AI481877A2ALV5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms