Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdccag3A2AIW0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms