Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms