Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms