Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A0A0U1RNP2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms