Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms