Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit3W8DXL4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms