Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm5538W4VSP6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm5538W4VSP6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm5538W4VSP6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm5538W4VSP6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm5538W4VSP6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm5538W4VSP6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm5538W4VSP6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm5538W4VSP6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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