Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms