Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms