Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms