Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdac6Q9Z2V5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms