Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms