Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk1bQ9Z2C6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Upk1bQ9Z2C6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Upk1bQ9Z2C6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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