Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cldn6Q9Z262 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cldn6Q9Z262 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cldn6Q9Z262 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cldn6Q9Z262 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cldn6Q9Z262 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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